1、溶解性：
前面曾叙述过阳离子染料分子中的成盐烷基和阴离子基团影响染料的溶解性。此外，染色介质中如果有阴离子化合物，如阴离子型表面活性剂和阴离子染料，也会与阳离子染料结合形成沉淀。毛/腈、涤/腈等混纺织物不能用普通阳离子染料与酸性、活性、分散等染料同浴染色，否则将产生沉淀。一般加入防沉淀剂来解决此类问题。
2、对pH值敏感性：
一般阳离子染料稳定的pH范围是2.5～5.5。当pH值较低时，染料分子中的氨基被质子化，由给电子转变为吸电子基，引起染料颜色发生变化；若pH值较高，阳离子染料可能形成季胺碱，或结构被破坏，染料发生沉淀、变色或者褪色现象。如噁嗪染料在碱性介质中转变为非阳离子染料，失去对腈纶纤维的亲和力而不能上染。
3、配伍性：
阳离子染料对腈纶纤维的亲和力比较大，在纤维中的迁移性能不好，难以匀染。不同染料对同一纤维的亲和力不同，在纤维内部的扩散速率也不相同，当上染速率差别较大的染料进行拼混时，染色过程中容易发生色泽变化、染色不匀的现象；而上染速率接近的染料拼混时，它们在染浴里浓度比例基本不变，使产品的色泽保持一致，染色比较均匀。这种染料拼染的性能称为染料的配伍性。
为了使用方便，人们用数值表示染料的配伍性能，通常用K 值表示。采用黄、蓝两色标准染料各一套，每套有五个上染速率不同的染料组成，共有五个配伍值（1，2，3，4，5），上染速率大的染料配伍值小，染料的迁移性和匀染性差，上染速率小的染料其配伍值大，染料的迁移性和匀染性较好。将待测染料与标准染料逐一进行拼染，然后对染色效果给予评价，定出待测染料的配伍值。
染料的配伍值和其分子结构存在一定的关系。染料分子中引入疏水性基团，水溶性下降，染料对纤维的亲和力上升，上染速率提高，配伍值减小，在纤维上的迁移性和匀染性降低，给色量增加。染料分子中某些基团因几何构型而引起空间障碍，也使染料对纤维的亲和力下降，配伍值增加。
4、耐晒性能：
染料的耐晒性能与其分子结构有关。共轭型阳离子染料分子中阳离子基团是比较敏感的部位，受光能作用后易从阳离子基团所处位置活化，然后传递至整个发色系统，使之遭受破坏而褪色，共轭型三芳甲烷类、多甲川类和噁嗪类耐晒牢度都不好。隔离型阳离子染料分子中的阳离子基团与共轭系统间被联结基隔开，即使在光能的作用下被活化，也不易将能量传递给发色的共轭系统，使之保存完好，所以耐晒牢度优于共轭型。
